Название склоняется: в наукограде Дубне.
Правильно: В городе Дубне, в штате Техас. Подробнее см. в «Письмовнике».
Обстоятельственное сочетание в семье потомственных физиков можно считать уточнением обстоятельства в Дубне (уточнение — это переход от более широкого понятия к более узкому); в этом случае логическое ударение будет нести как одно, так и другое обстоятельство. Однако обстоятельство в Дубне само по себе достаточно конкретно, а потому в обязательном уточнении не нуждается. Без запятой логическое ударение будет нести только обстоятельство в семье потомственных физиков.
См. в «Письмовнике».
Пожалуйста, поясните нам, что мы должны объяснить. Сформулируйте вопрос.