С точки зрения русского языка верно: в срок не более 5 (пяти) рабочих дней.
Обстоятельство в срок до... конкретизирует обстоятельство предварительно с более общим значением, а значит, в срок до... нужно выделить запятыми как пояснение.
Запятые нужны, если оборот с как содержит оттенок причинного значения: Он, как добросовестный работник, выполнил задание в срок (= «он выполнил задание в срок, потому что он добросовестный работник»). Если такого оттенка значения нет, запятые не ставятся.
Верно: не поставленный в срок товар.
Верен второй вариант.
Запятая не нужна.
Запятые не нужны.