Следует писать слитно.

Это краткое причастие, пишется раздельно с НЕ.

Оба варианта корректны.

Запятая не ставится.

Такое произношение неправильно. Несмотря на то что буква Ф называется [эф], в некоторых буквенных аббревиатурах, начинающихся с Ф, закрепилось произношение этой буквы как [фэ] (т. е. так, как Ф произносится в разговорной речи). Отчасти это объясняется артикуляционными законами, отчасти (как полагает известный лингвист  К. С. Горбачевич) – нашей «языковой ленью». К такого рода аббревиатурам относится и ФБР: единственно верный вариант произношения, зафиксированный в словарях (в том числе в словарях, адресованных работникам эфира), – [фэ-бэ-эр].

Верен первый вариант.

Правилами это не регулируется, обычно произносят [эр жэ дэ] (аналогично аббревиатуре РЖД), редко - по буквам английского алфавита [ар зэд ди].