Тире уместно.
О краткой форме прилагательного см. здесь.
Лучше: Неэффективные и отключенные из-за низкого CTR фразы уточняются системой.
Запятая ставится.
Запятая не требуется.
Словарями современного русского языка слово який не фиксируется, хотя употребления в речи найти можно. Известен фразеологизм всякий-який.