Глагол и отглагольное существительное совсем не обязательно должны управлять одним и тем же падежом. Правильно: угрожать применением, но угроза применения.
Оборот исходящая из региона надо выделить запятыми.
См. статью И. Добродомова «Кто такая кузькина мать?».
Запятая не нужна. Между однородными придаточными, соединенными соединительными или разделительными союзами, запятая не ставится. А перед придаточным (после тогда) запятая ставится.
Сформулируйте вопрос.
В обоих случаях предпочтительно без запятых.